함양군은 6월부터 7월에 이어지는 긴 장마기간으로 식량작물, 원예, 특작 등 각종 농작물이 일조부족 등으로 연약해져 있고 장마철에 자주 발생하는 역병, 탄저병 등의 병해충 발생과 집중호우 등으로 인한 습해 우려가 높아 작목별 현장지도를 강화하고 있다.

현재 농업인들이 많이 재배하고 있는 고추, 들깨 등 밭작물은 장마철 빗물의 이동으로 전파되는 역병, 탄저병, 시들음병 등이 주로 문제가 되고 사과 등 과수는 겹무늬 썩음병, 점무늬 낙엽병 등이 우려되고 있다.

또한 집중 호우 시 토양이 쓸려 내려가거나 고추 등 작물이 넘어지고 침수 등으로 인한 습해의 가능성도 높아지고 있다